2. VKL-Liga Saison 2008/2009 FC St. Pauli
| Spieltag | Heim | | Gast | Ergebnis | Treffer |
| Spieltag 1 | FC St. Pauli | : | VfL Osnabrück | 3 : 0 | 692 : 384 |
| Spieltag 2 | Greuther Fürth | : | FC St. Pauli | 0 : 3 | 183 : 317 |
| Spieltag 3 | FC St. Pauli | : | SC Rot-Weiß Oberhausen | 3 : 0 | 825 : 392 |
| Spieltag 4 | 1. FC Kaiserslautern | : | FC St. Pauli | 0 : 3 | 246 : 368 |
| Spieltag 5 | FC St. Pauli | : | 1860 München | 0 : 3 | 989 : 1249 |
| Spieltag 6 | Hansa Rostock | : | FC St. Pauli | 3 : 0 | 804 : 636 |
| Spieltag 7 | FC St. Pauli | : | Alemannia Aachen | 3 : 0 | 1390 : 1015 |
| Spieltag 8 | FC Augsburg | : | FC St. Pauli | 1 : 2 | 958 : 842 |
| Spieltag 9 | FC St. Pauli | : | SV Wehen | 0 : 3 | 162 : 340 |
| Spieltag 10 | MSV Duisburg | : | FC St. Pauli | 2 : 1 | 1658 : 1525 |
| Spieltag 11 | FC St. Pauli | : | 1. FC Nürnberg | 0 : 3 | 607 : 1414 |
| Spieltag 12 | SC Freiburg | : | FC St. Pauli | 1 : 2 | 1875 : 2286 |
| Spieltag 13 | FC St. Pauli | : | Rot-Weiss Ahlen | 0 : 3 | 133 : 197 |
| Spieltag 14 | FSV Mainz 05 | : | FC St. Pauli | 1 : 2 | 410 : 476 |
| Spieltag 15 | FC St. Pauli | : | FC Ingolstadt | 0 : 3 | 257 : 396 |
| Spieltag 16 | FC St. Pauli | : | TuS Koblenz | 1 : 2 | 583 : 610 |
| Spieltag 17 | FSV Frankfurt | : | FC St. Pauli | 0 : 3 | 134 : 285 |
| Spieltag 18 | VfL Osnabrück | : | FC St. Pauli | 2 : 1 | 559 : 590 |
| Spieltag 19 | FC St. Pauli | : | Greuther Fürth | 1 : 2 | 580 : 609 |
| Spieltag 20 | SC Rot-Weiß Oberhausen | : | FC St. Pauli | 1 : 2 | 571 : 476 |
| Spieltag 21 | FC St. Pauli | : | 1. FC Kaiserslautern | 3 : 0 | 3222 : 1507 |
| Spieltag 22 | 1860 München | : | FC St. Pauli | 3 : 0 | 2784 : 1180 |
| Spieltag 23 | FC St. Pauli | : | Hansa Rostock | 0 : 3 | 465 : 1363 |
| Spieltag 24 | Alemannia Aachen | : | FC St. Pauli | 1 : 2 | 1702 : 1724 |
| Spieltag 25 | FC St. Pauli | : | FC Augsburg | 0 : 3 | 1324 : 2087 |
| Spieltag 26 | SV Wehen | : | FC St. Pauli | 3 : 0 | 383 : 164 |
| Spieltag 27 | FC St. Pauli | : | MSV Duisburg | 0 : 3 | 775 : 1604 |
| Spieltag 28 | 1. FC Nürnberg | : | FC St. Pauli | 2 : 1 | 1643 : 1334 |
| Spieltag 29 | FC St. Pauli | : | SC Freiburg | 3 : 0 | 1508 : 1399 |
| Spieltag 30 | Rot-Weiss Ahlen | : | FC St. Pauli | 0 : 3 | 190 : 435 |
| Spieltag 31 | FC St. Pauli | : | FSV Mainz 05 | 3 : 0 | 438 : 296 |
| Spieltag 32 | FC Ingolstadt | : | FC St. Pauli | 3 : 0 | 495 : 371 |
| Spieltag 33 | TuS Koblenz | : | FC St. Pauli | 2 : 1 | 931 : 985 |
| Spieltag 34 | FC St. Pauli | : | FSV Frankfurt | 3 : 0 | 282 : 166 |